神元健児

Profile

2012年東京大学理学部生物化学科を卒業。2017年東京大学大学院理学系研究科修了、理学博士。2017年東京大学分子細胞生物学研究所、先導的研究教育プログラム助教。2017年から米国ワシントン大セントルイスでポスドク研究員、2022年からは同大学で上級研究員。2024年から大阪大学微生物病研究所准教授を経て、2025年より大阪大学微生物病研究所、環境応答部門教授。大阪大学WPIヒューマン・メタバース疾患研究拠点特別研究部門、1細胞ダイナミクスモデリング分野教授を兼任。

Publication

1. Single-cell lineage capture across genomic modalities with CellTag-multi reveals fate-specific gene regulatory changes. Jindal, K., et al., Nature Biotechnology (2024) 42, 946–959.
2. Defining cardiac functional recovery in end-stage heart failure at single-cell resolution. Amrute, J.M. et al., Nature Cardiovascular Research. (2023) 2, 399–416.
3. Dissecting cell identity via network inference and in silico gene perturbation. Kamimoto, K.,et al., Nature (2023) 614, 742–751.
4. Gene regulatory network reconfiguration in direct lineage reprogramming. Kamimoto, K., et al., Stem Cell Reports (2023) 18, 1, 97–112
5. The coding and long noncoding single-cell atlas of the developing human fetal striatum. Bocchi, V.D., et al., Science (2021) 1979-372. 10.1126/science.abf5759,
6. Single-cell mapping of lineage and identity in direct reprogramming. Biddy, B.A., et al., Nature (2018) 564, 219–224.

研究室紹介