| 分子細菌学分野 | 教授 | 堀口 安彦 | 
| ウイルス感染制御分野 | 教授 | 塩田 達雄 | 
| 分子ウイルス分野 | 教授 | 松浦 善治 | 
| 感染病態分野 | 教授 | 熊ノ郷 淳 (IFRec 兼任) | 
| 分子免疫制御分野 | 教授 | 菊谷 仁 (IFRec 兼任) | 
| 免疫不全疾患研究分野 | 教授 | 木下 タロウ (IFRec 兼任) | 
| 自然免疫学分野 | 教授 | 審良 静男 (IFRec 兼任) | 
| 細胞機能分野 | 教授 | 目加田 英輔 | 
| 免疫化学分野 | 教授 | 荒瀬 尚 (IFRec 兼任) | 
| 分子遺伝研究分野 | 教授 | 野島 博 | 
| 発癌制御研究分野 | 教授 | 岡田 雅人 | 
| 情報伝達分野 | 教授 | 高倉 伸幸 | 
| 細胞制御分野 | 教授 | 吉森 保 | 
| ウイルス免疫分野 | 教授 | 生田 和良 | 
| 遺伝子機能解析分野 | 教授 | 岡部 勝 | 
| ゲノム情報解析分野 | 教授 | 安永 照雄 | 
| 感染症国際研究センター 臨床感染症学研究グループ  | 
    特任教授 | 大石 和徳 | 
| 感染症国際研究センター ゲノム病原細菌学研究グループ  | 
    特任教授 | 飯田 哲也 | 
| 感染症国際研究センター 感染症学免疫学融合グループ  | 
    特任准教授 | 永井 宏樹 | 
| 感染症学免疫学融合プログラム推進室 藤井グループ  | 
    准教授 | 藤井 穂高 | 
| 自然免疫学 | 教授 | 審良 静男 (微研兼任) | 
| 糖鎖免疫学 | 教授 | 木下 タロウ (微研兼任) | 
| 感染病態分野 | 教授 | 熊ノ郷 淳 (微研兼任) | 
| 免疫化学 | 教授 | 荒瀬 尚 (微研兼任) | 
| 免疫機能統御学 | 教授 | 岸本 忠三 | 
| 免疫発生学 | 教授 | 平野 俊夫 | 
| 免疫動態学 | 教授 | 宮坂 昌之 | 
| 粘膜免疫学 | 教授 | 竹田 潔 | 
| 分子免疫制御 | 教授 | 菊谷 仁 (微研兼任) | 
| 生体機能イメージング | 教授 | 吉岡 芳親 |